Fue fundada el 26 de noviembre de 1.964, inagurándose oficialmente el 27 de mayo de 1.965 con el lema:

Su primer presidente fue el Dr. Pedro María Gómez quien en su discurso inaugural ya vaticinaba el éxito de esta Asociación, por motivos de salud tuvo que ceder el relevo al 2º presidente el Don José María de Otazu quien ostenta el cargo hasta 1.983.

Durante su período se crean prácticamente la totalidad de las delegaciones existentes en la actualidad permitiendo pasar de las 200 donaciones de 1.965 a las 17.000 de 1.983. Este año y con la Asociación totalmente consolidada y el Banco de Sangre de Gipuzkoa recién creado, accede a la presidencia Don Mikel Urreta que en sus 12 años de mandato ve como la Asociación logra un incremento importante de las donaciones, alcanzándose las 30.000 unidades el año 1.992.

En la actualidad y desde 1.995 preside la Asociación Don Juan Carlos Redondo.

Desde que se fundara en 1.964, en Gipuzkoa se han donado más de 550.000 unidades de sangre gracias a las cuales se han salvado muchas miles de decenas de vidas.